ウインドブロウでは一度ラスボスを倒してクリアすると開発中のカスタム難易度のロックが解除される
ステージ出撃に使う大砲の左横に看板が設置され、そこから難易度変更が行えるようになる

しかし開発中なだけあってバランスは安定していない
とはいえ、バージョン初期のクソ難易度だった頃と比べると、ギフトやレアリティに関するアップデートでかなり是正された
しかし今度は全体的にやや簡単になってしまっている（v0.9beta現在）

難易度は全部で5段階あり、クリアした難易度の1つ上のものが解禁されていく

難易度2（曇り）以降は難易度に応じて新たな敵が多数登場するようになる
詳しくは特殊な敵の記事を参照

晴天

• 基本の難易度

曇り

敵の体力： +40%
敵のダメージ： +25%
獲得した歯車： +25%
温泉はバイオーム2回ごとに1つだけ登場する

• 回復リソースが減ったことでより慎重な立ち回りが求められる
• 難易度1では登場しなかった新たな敵が多数登場するようになる

強風

敵の体力： +80%
敵のダメージ： +50%
獲得した歯車： +50%
エリートの特徴が強化される
尽きかけの温泉はバイオーム2回ごとに1つだけ登場する

• やや難易度は高いがあまり特筆するようなことはなく、v0.9beta現在ではここまではクリアしやすいようになっている

暴風雨

敵の体力： +120%
敵のダメージ： +75%
獲得した歯車： +75%
エリートの特徴が強化される
温泉はない

• 回復がさらに減るというか温泉が無くなるが、レアなサブ効果を持つ武器や回復系のギフト、ショップでの購入だったりで工夫すればなんとかなるちょうどいい難易度
  プレイヤーはある程度考えて立ち回る必要がある
• 以前はこの難易度から地獄だったが、ギフトやレアリティアプデでほどよい難しさの難易度に変貌した
• この難易度から産卵場の例の敵が強いものに置き換わる

大変動

敵の体力： +250%
敵のダメージ： +150%
獲得した歯車： +100%
エリートの特徴がさらに強化される
温泉はない

• 前の難易度の2倍
  敵の火力が高いので気を抜くと一気にやられてしまうことがある
  調子に乗って回復薬使わないプレイをしているとミスって死にがち
• エリートも複数の能力を持っているとかなり厄介のため、瞬殺できる装備がない=長期戦で被弾を避けられない場合はスルー安定だったりする
• v0.9のレアリティに関するアプデで難易度が比較的低下した
  「ダメージブーストは取らない」などの縛りプレイをしない限りはクリア自体はしやすくなっている
• この難易度から序盤の雑魚敵まで強いものに置き換わる

アップデート履歴

• v0.9beta
  微調整された
  経験値という謎のパラメータがあるが現時点では不明→beta終了後削除された
  「獲得経験値： +25%」などの表記だった
  ・曇り：敵の体力：+40% （以前は+25%）｜コグ：+25% （以前は+15%）、経験値+25%
  ・強風：敵の体力：+80% （以前は+75%）｜コグ：+50% （以前は+30%）｜アイテムボーナスレベル削除、経験値+50%、エリートの特徴が強化される
  ・暴風雨：敵の体力：+120% （以前は+100%）｜コグ：+75% （以前は+50%）｜アイテムボーナスレベル削除、経験値+75%
  ・大変動：敵の体力：+250% （以前は+200%） ｜アイテムボーナスレベル削除、経験値+100%